但到至今都还没有办理退房手续。水电气这些都还没结清。我应该怎么处理？

首先，开具租房发票是出租方的义务，即便租客存在未结清费用和损坏电器问题，也不能成为拒绝开票理由。你可以先和租客沟通，说明他未结清费用和电器损坏情况，从押金里扣除相应费用，剩余退还，然后为其开具发票。若沟通不成，你先开票，再通过协商或其他合适途径解决费用和赔偿问题。
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租房者9月9号到期至今未办理退房手续且水电气未结清、电器损坏，您作为房东未退2000元押金，现在他要求开具租房发票，您是否应该开具发票需结合具体情况判断。
您仍有义务向租房者开具租房发票。

如果租房者已按租赁合同约定支付了全部租金，即使其存在未结清水电气费用、损坏电器等违约行为，您也不能以此为由拒绝开具发票，开具发票是出租方的法定义务，与租房者是否存在其他违约行为无关。

若租房者尚未支付全部租金，您可以要求其先支付租金，再为其开具相应金额的发票，但同样不能完全拒绝开具发票义务。
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针对租房者要求您开具租房发票的问题，我们可以依据相关法律规定来分析您是否有开具义务。
根据《中华人民共和国税收征收管理法》第二十一条规定：“税务机关是发票的主管机关，负责发票印制、领购、开具、取得、保管、缴销的管理和监督。单位、个人在购销商品、提供或者接受经营服务以及从事其他经营活动中，应当按照规定开具、使用、取得发票。发票的管理办法由国务院规定。”在您与租房者的租赁关系中，您作为提供租赁经营服务的一方，租房者支付租金后，您就应当按照规定为其开具发票。租房者9月9号到期虽未办理退房手续、存在水电气未结清和电器损坏等情况，但这属于双方之间的租赁合同纠纷，不能成为您拒绝履行开具发票这一法定义务的理由。因此，无论租房者是否存在违约行为，只要其已支付租金，您就有义务为其开具租房发票。
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租房者在未办理退房手续、费用未结清且电器损坏的情况下要求开具发票，您可以按以下行动建议处理。
1、与租房者协商处理：主动联系租房者，告知其需要先办理退房手续、结清水电气费用并就电器损坏问题达成赔偿协议，然后您会为其开具租房发票。这样可以同时解决退房相关纠纷和发票开具问题。
2、核实租金支付情况：确认租房者是否已足额支付租赁合同约定的租金，若已支付，准备好相关资料为其开具发票；若未足额支付，明确告知其需补足租金后再开具对应发票。
3、依法开具发票：在租房者履行相关义务或您确认其已支付租金后，及时到税务机关或通过正规渠道为租房者开具租房发票，避免因未开具发票而产生税务风险。
4、保留相关证据：在与租房者沟通协商过程中，注意保留聊天记录、通话录音等证据，以及租房合同、租金支付凭证等，以防后续发生纠纷时作为证据使用。
选择解决方案时，应重点考虑如何在履行开具发票义务的同时，维护自身合法权益，优先通过协商解决退房及费用纠纷。如果您在处理过程中遇到困难，建议进一步向专业律师咨询，以获得更详细的指导。
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租房者要求开具租房发票，您作为房东若处理不当可能会面临以下法律风险。
1、税务处罚风险：如果您无正当理由拒绝为已支付租金的租房者开具发票，根据《中华人民共和国税收征收管理法》等相关规定，税务机关可能会对您处以罚款。例如，租房者向税务局举报后，税务机关经调查确认您存在拒开发票行为，可能会责令您限期改正，并可处1万元以下的罚款。
2、民事赔偿风险：虽然租房者未办理退房手续等存在违约行为，但您拒绝开具发票也可能给租房者造成损失，如租房者无法凭发票进行相关费用报销等，租房者可能会通过诉讼要求您赔偿因此造成的损失。比如，租房者因您未开具发票导致无法抵扣个人所得税，进而产生额外的税务支出，可能会要求您赔偿该部分损失。
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